Estou tendo o mesmo problema em diversos sites / ecommerces. Quando um cliente insere um cupom de desconto, o pagamento aparece o valor normal no checkout, mas o plugin do mercado pago retorna com o desconto em dobro no valor final cobrado, dando um desconto maior do que o devido. Somente acontece quando há a inserção do cupom, em carrinho pago com valor integral, sem uso de cupons, opera normalmente.