Beleza! Então amigo, no meu projeto eu não integrei o woocomerce com o pagseguro. Eu tinha um mesmo produto para duas Unidades diferentes da empresa, ou seja, cada unidade tinha uma conta no pagseguro. Criei os produtos lá no pagseguro e copiei o link. Deixei woocomerce tipo catálogo e criei um form de seleção para alternar entre uma Unidade e outra. Adicionei o botão comprar no form indicando para o link do pagseguro. No meu caso resolveu o problema. Fica a dica, às vezes te ajuda em algo. Abraço