У меня бала такая же ерунда. Товары из 1с выгружались в файлы offers0_1.xml и import0_1.xml, но на сайте не обновлялись. В моём случае выполнению обновления мешали 2 других плагина Jetpack и W3 Total Cache . Jetpack отключил полностью, а в W3 Total Cache отключил Page Cache и всё заработало как по маслу. Если у вас установлены другие плагины кэширования, пробуйте их отключить.
У меня была такая же проблема. Если остаются архивы, значит у вас установлена старая доработанная кем-то версия плагина. Которую, скорей всего, вы скачивали с GitHub.
Смело её можно удалять и устанавливать новую версию через поиск плагинов в WP.
