Basta configurar as opção do plugin.
Quem calcula as parcelas e faz calculo de juros é o próprio pagar.me.
tudo que você precisa fazer é configurar no painel o que você quer.
Quantas parcelas você vai permitir, valor mínimo de parcela (exemplo se falar que é 10 reais, não vai ter nenhuma parcela com menos do que 10), taxa de juros (quanto de juros “%” cobrar) e por último quantas parcelas serão sem juros, assim você pode oferecer até 3, 5, 10 ou o que seja sem juros e o resto o cliente paga juros.
Isso é configuração e regras de negocio que são básicos para qualquer negocio online ou não!